В 1822 году Джефферсон-Сити был назначен столицей штата Миссури. Тогда городу был всего один год, авторитет его был ещё слабым, и губернатор Джон Миллер сделал то, что сделал бы любой, чтобы укрепить его. Он решил построить там тюрьму строгого режима.
В 1836 году тюрьма штата Миссури приняла своего первого заключённого, а в 1842 году прибыла первая осуждённая женского пола.
Корпуса тюрьмы и близлежащие здания строились руками заключённых, а к 1885 году шесть крупных обувных компаний пользовались их неоплачиваемым трудом.
С 1917 года в тюрьме некоторое время пребывала активистка Эмма Гольдман, которую в США считали «самой способной и опасной» анархисткой в стране. Она собрала женщин-заключённых и возглавила бунт против несправедливого обращения. Её агитации были настолько успешными, что в 1919 году администрация тюрьмы выпустила её на свободу, даже несмотря на то, что она не смогла полностью оплатить полагавшийся штраф в 10 000 долларов.
В 1932 году в тюрьме содержалось 5200 заключённых, больше, чем где-либо в США. Она считалась одной из самых действенных тюрем в стране. Однако многочисленные физические травмы и смерти в этом учреждении, а также крупный бунт в 1954 году привели к тому, что журнал Time назвал его «самыми кровавыми 47 акрами в Америке».
В этой тюрьме содержалось много известных личностей. Чарльз «Сонни» Листон, отбывая здесь срок, научился боксировать, и всего через год после условно-досрочного освобождения в 1952 году начался его стремительный взлёт к славе, когда он выиграл Национальный чемпионат в тяжёлом весе 1953 года в Чикаго.
В 1959 году после ограбления магазина к 20 годам тюрьмы был приговорён Джеймс Эрл Рэй, но в 1967 году ему удалось сбежать, спрятавшись в грузовике, перевозившем хлеб. Всего через год, 4 апреля 1968 года, Рэй убил Мартина Лютера Кинга-младшего.
До 1937 года казни в тюрьме проводились местным шерифом. В сентябре того же года губернатор Ллойд Старк подписал закон, согласно которому казни должны были проходить с использованием смертельного газа. Тридцать девять заключённых в период с 1937 по 1965 год были отправлены в газовую камеру в небольшом здании в стороне от главного корпуса.
Тюрьма считалась старейшим действующим исправительным учреждением к западу от реки Миссисипи вплоть до её закрытия 15 сентября 2004 года. Заключённых перевели в близлежащий исправительный центр Джефферсон-Сити.
В настоящее время тюрьма является музеем. Здесь было проведено более 100 организованных паранормальных исследований. Помимо исторических экскурсий, в музее проходят ночные туры с охотой за привидениями.
 Тюрьма штата Миссури
        Тюрьма штата Миссури
     Эмма Гольдман доставила много хлопот во время своего пребывания здесь
        Эмма Гольдман доставила много хлопот во время своего пребывания здесь
     Дом начальника тюрьмы
        Дом начальника тюрьмы
     Камера Чарльза “Сонни” Листона, который стал чемпионом мира в супертяжёлом весе и в 1964 году уступил свой боксерский титул Кассиусу Клею (Мухаммеду Али)
        Камера Чарльза “Сонни” Листона, который стал чемпионом мира в супертяжёлом весе и в 1964 году уступил свой боксерский титул Кассиусу Клею (Мухаммеду Али)
     Фасад тюрьмы штата Миссури
        Фасад тюрьмы штата Миссури
     Внутри самого старого тюремного блока
        Внутри самого старого тюремного блока
     Тюрьма штата Миссури
        Тюрьма штата Миссури
     Рисунок одного из заключённых в память о Чарльзе “Сонни” Листоне на главной стене, выходящей во двор, где Сонни провёл свой первый показательный бой с профессиональным боксёром-тяжеловесом Турманом Уилсоном
        Рисунок одного из заключённых в память о Чарльзе “Сонни” Листоне на главной стене, выходящей во двор, где Сонни провёл свой первый показательный бой с профессиональным боксёром-тяжеловесом Турманом Уилсоном
     Бейсбольная площадка в тюрьме штата Миссури
        Бейсбольная площадка в тюрьме штата Миссури
     Газовая камера
        Газовая камера
     Камеры смертников
        Камеры смертников
     Заброшенная баскетбольная площадка
        Заброшенная баскетбольная площадка
     Ворота тюрьмы штата Миссури
        Ворота тюрьмы штата Миссури