Территория, на которой сегодня стоит замок Санта-Сесилия, был частью асьенды Сан-Франциско Хавьер, где располагались серебряные рудники. На протяжении столетий здесь шла добыча серебра, но со временем асьенда пришла в упадок, как и другие рудники города Гуанахуато. К 1916 году залежи серебра здесь полностью иссякли, и предприятие было закрыто.
В течение первых десятилетий XX века в зданиях асиенды располагалась больница и хоспис. В итоге эти постройки снесли, а территорию выкупил дон Мануэль Кесада Бренди, планировавший построить здесь гостиницу.
Рудник Санта-Сесилия, был одним из последних оставшихся объектов, связанных с добычей серебра. В честь него и решили назвать отель. Строительство здания в стиле средневекового европейского замка началось в 1951 году и уже через год было завершено. Изначально в отеле было всего 20 номеров, но после ремонта и расширения их число увеличилось до 110.
На территории отеля-замка снималось несколько мексиканских фильмов и сериалов, а в его номерах останавливались знаменитости и мексиканские кинозвёзды, в тоом числе Мария Феликс, а также рок-звезда Алекс Лора.
Любители замковой культуры будут рады узнать, что среди самых известных иностранных постояльцев отеля были настоящие европейские монархи: королева Великобритании Елизавета II и король Испании Хуан Карлос I. Однако, учитывая, что здание было построено не в оборонительных целях, Санта-Сесилия не является официально замком, хотя отель по-прежнему представляет собой роскошное зрелище на холмах Гуанахуато.